Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms