Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35F4A4IF30 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms