Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms