Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms