Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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