Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
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SH3BP1Q9Y3L3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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