Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms