Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms