Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNFSF18Q9UNG2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms