Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK13

ZNF221, Zinc finger protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF221Q9UK13 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ZNF221Q9UK13 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF221Q9UK13 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF221Q9UK13 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF221Q9UK13 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF221Q9UK13 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF221Q9UK13 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms