Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms