Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSFQ9UBX1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms