Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGC1AQ9UBK2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms