Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF7Q9UBF6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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