Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms