Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms