Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms