Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIS18AQ9NYP9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms