Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms