Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms