Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms