Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms