Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms