Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms