Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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