Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms