Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms