Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms