Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARD11Q9BXL7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms