Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms