Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms