Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms