Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HINFPQ9BQA5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HINFPQ9BQA5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HINFPQ9BQA5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HINFPQ9BQA5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HINFPQ9BQA5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HINFPQ9BQA5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HINFPQ9BQA5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HINFPQ9BQA5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HINFPQ9BQA5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HINFPQ9BQA5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HINFPQ9BQA5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HINFPQ9BQA5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms