Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP88Q99567 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms