Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRBNQ96SW2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms