Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms