Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KC1Q96S38 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms