Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms