Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL15Q96M94 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms