Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms