Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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