Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms