Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM4SF18Q96CE8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms