Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTSSAQ969W0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSAQ969W0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms