Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms