Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMTQ93088 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms