Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EXTL1Q92935 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL1Q92935 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms