Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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UBXN4Q92575 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN4Q92575 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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