Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAAF4Q8WXU2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAAF4Q8WXU2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms