Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms